内蒙古自治区防痨协会成立于1957年。1957年至1996年共进行过五次协会换届和会员代表大会及十几次的学术交流活动，期间一直作为"中国防痨协会内蒙古分会"参加中国防痨协会举办的各种学术交流活动。1996年以后，由于第五届协会及协会挂靠单位（内蒙古自治区结核病防治所）主要负责同志的工作变更及退休等原因而使协会的主要工作一度中断，2001年恢复后继续开展工作。协会挂靠单位为内蒙古第四医院、内蒙古自治区结核病防治研究所。