院中心位于武汉市洪山区卓刀泉北路，占地面积约19万平方米，内设6个职能处、室和10个业务所、中心，即院中心办公室、党委办公室、人事科教处、财务处、监察室、总务后勤处、质量技术管理办公室、卫生应急管理办公室、生物制品管理办公室、传染病防治研究所、卫生监测检验防护所、血吸虫病防治研究所、慢性病防治研究所、健康教育所、预防医学信息研究所、食品药品安全评价中心。是全国专业设置最全、占地面积最大的省级疾病控制机构。

        先后通过国家实验室认可委认可、国家计量认证、食品检验机构资质认定，认可种类包括食品（保健食品）、化妆品（日化品）、化学品、涉水产品、消毒产品、灭鼠杀虫药械、公共场所、防病检验、中成药添加违禁化学品、空气等19大类 629项，出具的检验报告在欧美和亚太地区等50多个国家获得承认。现拥有国家药监局认证GLP实验室、农业部认证的农药毒理学A级实验室、国家实验室认可委认可和国家科技部与国家卫生计生委资格审批的生物安全三级实验室。国家卫生计生委认定的保健食品毒理和功能实验室、化妆品卫生行政许可检验机构实验室、艾滋病检测确证中心实验室、脊髓灰质炎监测实验室、农药毒理学实验室、消毒鉴定实验室、卫生杀虫剂药效试验室、血吸虫病诊断参比实验室、结核病检测参比实验室等。被国家卫生计生委授予放射卫生技术服务甲级资质、埃博拉病毒检测资质。被省卫生计生委授予省级食品添加剂检测资质、从业人员健康体检检验资质。被省科技厅授予 "应用毒理湖北重点实验室"，成为全省首批十五个重点实验室之一。

院中心 被中共中央组织部评为"2003年全国防治非典型肺炎工作先进基层党组织"，被全国总工会授予"2008年全国五一劳动奖状"、"2010年全国五一劳动奖状",被卫生部、中国人民解放军总后勤部联合授予"2008年全国抗震救灾医药卫生先进集体"。分别在 2009年、2011年、2014年连续三届获中央文明委授予的"全国文明单位"荣誉称号；2008-2014年连续获得省文明委授予的"省级最佳文明单位"荣誉称号。2012年被国家卫生计生委授予"全国医药卫生系统创先争优活动先进集体"称号，被中共湖北省委授予"党建工作先进单位"称号。2013年被人社部、国家卫生计生委联合授予"全国艾滋病防治工作先进集体"称号，被省委组织部授予"湖北人才工作十强单位"。 2014年被省政府表彰为"全省血吸虫病防治工作先进集体"， 获湖北省总工会颁发的"女职工建功立业标兵岗"称号，被共青团湖北省委、省卫生计生委授予"优秀青少年维权岗" 称号。近年来，还多次被省总工会授予"全省模范职工之家"、被省委授予"党建先进单位"、被省直机关工委授予"先进基层党组织"等光荣称号。